Членом-корреспондентом ВАСХНИЛ я стал в марте 1975 г. как-то незаметно для себя: 7-го марта 1975 г. вечером позвонил, сообщил об этом и поздравил меня академик Константин Захарович Будин. Академиком ВАСХНИЛ избран 26 сентября 1978 года. Для меня эти выборы оказались сложными. Как потом стало известно, по растениеводству объявили только одно место, и оно было «забронировано» поддержкой ЦК. Об этом узнали несколько старейших и заслуженных академиков, они обратились в Отдел науки с просьбой выделить для В. Г. Конарева дополнительную единицу и обеспечить его поддержкой. Об этом мне сказали только после выборов. Накануне позвонил президент П. П. Лобанов, попросив подготовить краткие (на половину страницы) сведения о себе, через час мне позвонит машинистка. Он сказал, что с этими сведениями пойдет в ЦК, и добавил: «Мы намерены добиться их рекомендации для избрания Вас в академики».
Фактически, все это произошло вскоре после основательного обсуждения направления и итогов работ нашего отдела на расширенном Бюро Президиума ВАСХНИЛ (17.02.1977), а также более ранних участий с докладами в сессиях Академии, например «Проблемы белка в сельском хозяйстве» на тему: «Биохимические и молекулярно-генетические аспекты селекции зерновых на белок» (В. Г. Конарев, 1975. С. 131–140).
Так что выборы в академики, когда я узнал весь их механизм и об участии в них старейших ученых, стали для меня памятными и даже трогательными.
Когда я говорил своим новым коллегам о том, что вернуться в ВИР мне предлагал еще академик И. Г. Эйхфельд в 1945 году, сразу же после демобилизации из армии в связи с окончанием войны, они мне ответили: «Вы, Василий Григорьевич, вернулись в ВИР своевременно; вернись Вы всего на несколько лет раньше — лысенковцы не дали бы Вам работать в таком духе».
Главными задачами лабораторий отдела с момента их организации стали внедрение принципов и методов современной биологии в растениеводство, разработка молекулярно-генетических подходов к изучению мировых ресурсов культурных растений и их сородичей как исходного материала для селекции. С того времени сложились три основных направления:
1) разработка принципов и методов белковых маркеров для геномного и генетического анализа растений на основе биологической специфичности белка;
2) изучение структурной и функциональной организации генома клеточного ядра, связанное с разработкой методов геномного анализа растений;
3) ресурсы растительного белка и проблемы его качества.
В изучении генома использовали разработанные еще в Оренбурге и Уфе, а также новые методы биохимии, цитохимии, иммунохимии, люминесцентной и электронной микроскопии. Исследования проводились совместно с Отделом биохимии и цитохимии БашФАН СССР. Были выяснены главные черты структурной и функциональной организации хромосом и предложена модель, в основе которой — структурные переходы в хроматине — субстанции хромосом. Она открыла нам новые возможности в изучении механизмов генетической регуляции клетки. На этой основе разработаны принципы и методы биохимической и цитохимической (спектральной, микроскопической, люминесцентной) оценки функциональной активности генома по структурному состоянию ДНК и хромосом. Доказана серологическая активность и специфичность гистонов — основных белков и так называемых «кислых белков» хромосом. На этой основе осуществлен геномный анализ естественных и синтетических амфидиплоидов, иммунохимический анализ состава и структурного состояния белков в хромосомах, что позволило приступить к разработке тонких методов генетического и филогенетического анализа растений по белкам клеточного ядра.
В ряду разработок, связанных с геномным анализом растений, как уже отмечалось, стоят исследования молекулярных механизмов преобразования генома в процессах видообразования, эволюции и функционирования.
Молекулярно-биологическому исследованию генома посвящено много исследований. Их результаты неоднократно докладывались на Всесоюзном биохимическом съезде и симпозиумах, организованных академиком Ильей Борисовичем Збарским по проблеме: «Клеточное ядро и его ультраструктуры».